海藻糖有三种不同的正位异构体 (Anomers)，即α，α-海藻糖 (又叫蘑菇糖，Mycose)，α，β-海藻糖 (新海藻糖，Neotrehalose)和β，β-海藻糖 (异海藻糖，Isotrehalose)。海藻糖可以几种固体形式存在，最常见的是二水化合物。海藻糖的稳定性比蔗糖好，与氨基酸、蛋白质等混合在加热的条件下，也不会发生美拉德反应。其溶解度约是蔗糖的2/3，渗透压与蔗糖、麦芽糖等双糖相同，甜度只有蔗糖的45%左右，留在口中的后味较清爽。

海藻糖是一种安全、可靠的天然糖类。海藻糖在自然界中许多可食用动植物及微生物体内都广泛存在，如人们日常生活中食用的蘑菇类、海藻类、豆类、虾、面包、啤酒及酵母发酵食品中都有含量较高的海藻糖。它是由两个葡萄糖分子以α,α,1,1-糖苷键构成的非还原性糖，自身性质非常稳定。

用途：组织改良剂；稳定剂；甜味剂；吸水剂（保湿剂）。可作为防止食品劣化、保持食品新鲜风味、提升食品品质。

海藻糖的特点：

1、海藻糖的低甜度（砂糖的45%）能降低糕点的整体甜味度，并提高材质本身具有的美味和香味

2、海藻糖可包含材料的油脂和分，同时隔离湿气。保持糕点的滋味。

3、由于保持其新鲜度和美味，强力防止冷冻时的水分流失，所以可根据各种需要进行制作。